Caracterizan estructura de proteína bacteriana clave para el medio ambiente

Posteado: en Bioinformatica, Ecologia, Medio ambiente, Microbiologia.

Científicos de los EE.UU del Departamento de Energía (DOE) y el Argonne National Laboratory han determinado la estructura de una proteína clave de una bacteria que podría ayudar en la biorremediación de sitios con suelos contaminados de uranio. Los investigadores, encabezados por el Argonne altos biofísico Marianne Schiffer, que se caracteriza la estructura de uno de los principales dominios de una proteína responsable de ciertos tipos de movimiento exhibido por la bacteria Geobacter sulfurreducens. Geobacter vive predominantemente en entornos bajos de oxígeno (anaerobicos) y genera energía mediante la transferencia de electrones a distintos aceptores metalicos de electrones, como los átomos de hierro o uranio. Esta habilidad sugiere que Geobacter pueden ser utilizados para la rehabilitación de determinados tipos de residuos peligrosos. Por ejemplo, cuando el uranio se reduce en este proceso a su forma insoluble, los ingenieros pueden eliminar el precipitado de uranio. Para llegar a las regiones de alta concentración de nutrientes (o para escapar de sustancias nocivas), ciertos tipos de bacterias utilizan un mecanismo denominado quimiotaxis. Por quimiotaxis de trabajo fiable, la célula debe ser capaz de convertir informacion externa sobre productos químicos en los procesos químicos internos - este proceso se conoce como la transducción de señales. “Una de las grandes preguntas en biología es cómo obtener las señales de fuera de la celula hacia el interior de la célula,” dijo Schiffer.

Comentarios (0) May 22 2008



Descifran genoma del gato domestico

Posteado: en Bioinformatica, Biotecnologia, Genómica.

Asi es nuestro amigo felino acaba de entrar a la era genómica incoporando sus valiosos genes que seran foco de investigacion a futuro. El gato viene a engrosar la lista de mamiferos que ya obtuvieron su genoma, tales como el perro, la vaca, chimpances, ratones, y nosotros mismos por su puesto.

¿Pero por que tendriamos la necesidad de conocer los genes de nuestros amigos los minimos?. Bien basicamente es debido a que ellos tienen en una lista de enfermedad muy similares a las nuestras aproximadamente 200, conociendo los detalles de su genoma podriamos comprender mejor estas y poder encontrar las vacunas para las mismas. Los gatos incluso tienen una version propia del SIDA, la diabetes, entre otras. Leer el resto »

Comentarios (2) Nov 01 2007


Modelo metabolico de Neisseria M.

Posteado: en B. Molecular y celular, Bioinformatica, Microbiologia.

Neisseria meningitids es un patogeno humano que puede infectar diversos sitios en nuestro cuerpo, las complicaciones que puede llegar a causar esta bacteria son la muerte y la inhabilidad en infantes jovenes frecuentemente. Las investigacion sobre dicho patogeno estan basadas en los antigenos potenciales y su aplicacion, inmunogeneticidad y mecanismos de patogenicidad. Sobre el metabolismo base no se ha trabajado mucho en los ultimos 25 años.

Utilizando la informacion genomica de N.meningitidis serogrupo B, disponible en las bases de datos junto con la informacion bioquimica y fisiologica proveniente de la literatura, hemos construido un modelo a escala del genoma sobre el flujo metabolico primario. Se han obtenido muchas predicciones utiles en experimentos in silico, incluyendo preferencia de substrato, un medio de cultivo minimo fue diseñado y probado con exito. GB.

Comentarios (0) Jul 07 2007


Computers & Biology

Posteado: en B. Molecular y celular, Bioinformatica, Citas.

Me encanta esta frase:

“Computers are to biology what mathematics is to physics.” — Harold Morowitz

Visto en: Artificial Intelligence and Molecular Biology - Lawrence Hunter.

Comentarios (0) Jul 05 2007


Biocomputadores a base de RNA

Posteado: en B. Molecular y celular, Bioinformatica, Biotecnologia.

Se ha probado con éxito el funcionamiento de biocomputadores implantados en un cultivo de células de hígado humano. Un equipo formado por científicos de las universidades de Harvard y Princeton ha comprobado que los biocomputadores pueden trabajar en células cultivadas de hígado humano, según informan en un artículo publicado por la revista Nature Biotechnology. Se trata, según sus responsables, de un paso crucial para construir finalmente ordenadores biológicos funcionales. Estos ordenadores son pequeños dispositivos implantables que pueden monitorizar la actividad y las características de las células humanas. Tendencias21.

A universal RNAi-based logic evaluator that operates in mammalian cells
: (Abstract)(Es): Automatas moleculares que combinan programacion sensible, permiten manipulacion programable de los sistemas biologicos. Se uso ARN(i) en celulas de riñon para construir una base computacional que implemente logica boleana general, que sirva para tomar decisiones basadas en “entradas” moleculas exogenas. Ver Abstract. Texto completo.

Comentarios (0) Jun 11 2007